L'église du couvent des Petits-Augustins est la partie la plus ancienne de l'École des beaux-arts. La chapelle hexagonale, à droite au fond de la grande nef unique, dite " chapelle des louanges " a été construite à partir de 1617 pour Marguerite de Navarre (1553-1615), épouse divorcée d'Henri IV. Après la dispersion de la plus grande partie des collections et l'attribution des locaux à l'École des beaux-arts, elle devient un dépôt lapidaire puis un Musée des copies de la Renaissance italienne et française : moulages, envois de Rome de peinture y sont rassemblés, dont la grande copie du Jugement dernier de Michel-Ange faite à Rome en 1833, par Xavier Sigalon (1788-1837).